Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFRLQ15198 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFRLQ15198 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms