Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM25Q14258 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms