Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCARB2Q14108 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCARB2Q14108 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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