Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1CQ13936 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1CQ13936 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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