Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FHL3Q13643 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FHL3Q13643 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FHL3Q13643 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FHL3Q13643 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms