Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATRQ13535 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRQ13535 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATRQ13535 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATRQ13535 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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