Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN3Q13064 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MKRN3Q13064 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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