Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMAN2Q12907 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN2Q12907 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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