Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 ROG1YGL144C 2058 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 FRE8YLR047C 2061 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 MRH1YDR033W 963 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 MRPL9YGR220C 810 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 YHL005CYHL005C 393 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 YKL091CYKL091C 933 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 HYM1YKL189W 1200 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 PRM6YML047C 1059 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 MRPL17YNL252C 846 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 PDS5YMR076C 3834 nt3.28□□□□□ -1.88
SMC6Q12749 TIF4631YGR162W 2859 nt3.27□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YPD1YDL235C 504 nt3.27□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 BMH2YDR099W 822 nt3.27□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 DYN2YDR424C 279 nt3.27□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 RMT2YDR465C 1239 nt3.27□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YFH7YFR007W 1062 nt3.27□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YGR111WYGR111W 1203 nt3.27□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.27□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 DUF1YOL087C 3351 nt3.27□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 PEX5YDR244W 1839 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 PDC2YDR081C 2778 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YGR017WYGR017W 894 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 PPX1YHR201C 1194 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 MBB1YJL199C 327 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 SDH3YKL141W 597 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 RPL8BYLL045C 771 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 SDO1YLR022C 753 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 DIA1YMR316W 1011 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YNL276CYNL276C 396 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 MED1YPR070W 1701 nt3.26□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 BUD4YJR092W 4344 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 FLO1YAR050W 4614 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 MDM36YPR083W 1740 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 UBP14YBR058C 2346 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 MAK5YBR142W 2322 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 CWH41YGL027C 2502 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 SRC1YML034W 2505 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 MRPL32YCR003W 552 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 FMN1YDR236C 657 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 HMF1YER057C 390 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 RPL23BYER117W 414 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 COA4YLR218C 453 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 RPL6AYML073C 531 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 PDR17YNL264C 1053 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 ART10YLR392C 1557 nt3.25□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 URB2YJR041C 3525 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 NSA2YER126C 786 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 DAL2YIR029W 1032 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 SMA2YML066C 1110 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 SUB1YMR039C 879 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 INO4YOL108C 456 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 RIF1YBR275C 5751 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 GIS4YML006C 2325 nt3.24□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 RIX1YHR197W 2292 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 DBP10YDL031W 2988 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YDL032WYDL032W 312 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 NRG1YDR043C 696 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 SEC4YFL005W 648 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 COG7YGL005C 840 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YGL204CYGL204C 306 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 CUP1-1YHR053C 186 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 CUP1-2YHR055C 186 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 AIM23YJL131C 1071 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 SWD3YBR175W 948 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 FUN30YAL019W 3396 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.23□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 TAO3YIL129C 7131 nt3.22□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 JIP5YPR169W 1479 nt3.22□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 TRM82YDR165W 1335 nt3.22□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 COM2YER130C 1332 nt3.22□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 SAD1YFR005C 1347 nt3.22□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YAT2YER024W 2772 nt3.22□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 TVP15YDR100W 432 nt3.22□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 PEX14YGL153W 1026 nt3.22□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 MRPL38YKL170W 417 nt3.22□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 YIL169CYIL169C 2988 nt3.21□□□□□ -1.89
SMC6Q12749 CCT7YJL111W 1653 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 DSE4YNR067C 3354 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 MIX14YDR031W 366 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 YDR442WYDR442W 393 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 YKL070WYKL070W 510 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 SFH1YLR321C 1281 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 YSF3YNL138W-A 258 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 GCY1YOR120W 939 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 DIM1YPL266W 957 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 YPR050CYPR050C 414 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 YDR061WYDR061W 1620 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 ECM21YBL101C 3354 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 SKO1YNL167C 1944 nt3.21□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 YKL100CYKL100C 1764 nt3.2□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 DBP7YKR024C 2229 nt3.2□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 MUB1YMR100W 1863 nt3.2□□□□□ -1.9
SMC6Q12749 ILS1YBL076C 3219 nt3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.3 ms