Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 NAB6YML117W 3405 nt2.9□□□□□ -1.94
YPQ1Q12010 SPO14YKR031C 5052 nt2.9□□□□□ -1.94
YPQ1Q12010 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YEL057CYEL057C 702 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 RPS25AYGR027C 327 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 RPL24BYGR148C 468 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YIL175WYIL175W 318 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 MET14YKL001C 609 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 URA5YML106W 681 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 CSI1YMR025W 888 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 TRI1YMR233W 681 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YOR387CYOR387C 621 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SIZ1YDR409W 2715 nt2.9□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SST2YLR452C 2097 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SSE2YBR169C 2082 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YMR018WYMR018W 1545 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 ATP16YDL004W 483 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 AST2YER101C 1293 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 COX6YHR051W 447 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SDH3YKL141W 597 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YLL037WYLL037W 381 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 LCB4YOR171C 1875 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YPL276WYPL276W 438 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 IOC3YFR013W 2364 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SEC15YGL233W 2733 nt2.89□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YEL075CYEL075C 369 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 ECO1YFR027W 846 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 RSM27YGR215W 333 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YIL054WYIL054W 318 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 DAL2YIR029W 1032 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 AIM25YJR100C 984 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YML037CYML037C 1023 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 FMP41YNL168C 780 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YNL184CYNL184C 327 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 RSM19YNR037C 276 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 MCT1YOR221C 1083 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 VPS3YDR495C 3036 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 APM3YBR288C 1452 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 ROM1YGR070W 3468 nt2.88□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YEL010WYEL010W 351 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 THO1YER063W 657 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YGR039WYGR039W 312 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SCM4YGR049W 564 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 PEF1YGR058W 1008 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YGR114CYGR114C 390 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SFH1YLR321C 1281 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SUB1YMR039C 879 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 TPT1YOL102C 693 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YDR131CYDR131C 1671 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 DRS2YAL026C 4068 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YPL216WYPL216W 3309 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 HBT1YDL223C 3141 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SQS1YNL224C 2304 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SPH1YLR313C 1593 nt2.87□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YLR108CYLR108C 1458 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 snR70snR70 164 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 OST5YGL226C-A 261 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YHL044WYHL044W 708 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 MMF1YIL051C 438 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YIR040CYIR040C 333 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 RPL17AYKL180W 555 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YKR011CYKR011C 1062 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 ERV15YBR210W 429 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 FLO1YAR050W 4614 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SIN3YOL004W 4611 nt2.86□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 UBP8YMR223W 1416 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 DNA2YHR164C 4569 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 PMR1YGL167C 2853 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 MSH2YOL090W 2895 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 RUB1YDR139C 234 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YVH1YIR026C 1095 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 MDV1YJL112W 2145 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YLR271WYLR271W 825 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YPR153WYPR153W 423 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 APD1YBR151W 951 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YAK1YJL141C 2424 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 RAX2YLR084C 3663 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 SAG1YJR004C 1953 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YGL176CYGL176C 1665 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 MTL1YGR023W 1656 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 ESC2YDR363W 1371 nt2.85□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 UTP5YDR398W 1932 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 WHI3YNL197C 1986 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 snR83snR83 306 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 YDR042CYDR042C 603 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 HTB1YDR224C 396 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 AIM11YER093C-A 414 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 LST7YGR057C 729 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 PET54YGR222W 882 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.84□□□□□ -1.95
YPQ1Q12010 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms