Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAGPQ0VAQ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAGPQ0VAQ4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms