Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGM3Q08188 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms