Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPN12Q05209 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPN12Q05209 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms