Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRB3Q04118 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms