Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SCN7AQ01118 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCN7AQ01118 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms