Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHOBP62745 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RHOBP62745 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RHOBP62745 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RHOBP62745 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RHOBP62745 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RHOBP62745 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOBP62745 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms