Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARF6P62330 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARF6P62330 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARF6P62330 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ARF6P62330 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ARF6P62330 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ARF6P62330 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARF6P62330 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARF6P62330 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARF6P62330 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ARF6P62330 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ARF6P62330 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARF6P62330 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms