Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNRPD1P62314 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPD1P62314 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms