Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVPABLB-1P60509 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms