Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSX2P58304 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VSX2P58304 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VSX2P58304 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VSX2P58304 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX2P58304 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX2P58304 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX2P58304 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX2P58304 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX2P58304 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX2P58304 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VSX2P58304 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VSX2P58304 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VSX2P58304 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VSX2P58304 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX2P58304 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX2P58304 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX2P58304 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VSX2P58304 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms