Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SUMO3P55854 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SUMO3P55854 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms