Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A3P53794 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A3P53794 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms