Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 FMP32YFL046W 624 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 RPA12YJR063W 378 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 TPT1YOL102C 693 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SPR2YOR214C 711 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 RPL20BYOR312C 519 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 HUT1YPL244C 1020 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SLM4YBR077C 489 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YBR090CYBR090C 369 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SPO14YKR031C 5052 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YJL049WYJL049W 1353 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 MAK5YBR142W 2322 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 PUF6YDR496C 1971 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YPS6YIR039C 1614 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 ERP3YDL018C 678 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 ATC1YDR184C 885 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 DYN2YDR424C 279 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 GTT2YLL060C 702 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SFH1YLR321C 1281 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SRL1YOR247W 633 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 HUA2YOR284W 732 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 NIP7YPL211W 546 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 APD1YBR151W 951 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 NDT80YHR124W 1884 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 FRE2YKL220C 2136 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN9P53437 REG1YDR028C 3045 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 HBT1YDL223C 3141 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 ATP16YDL004W 483 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 RPL13AYDL082W 600 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YDR133CYDR133C 336 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 THO1YER063W 657 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YGR073CYGR073C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 RPC25YKL144C 639 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SEC14YMR079W 915 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 THI80YOR143C 960 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 NOP4YPL043W 2058 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 CDC40YDR364C 1368 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YBP2YGL060W 1926 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 Q0255Q0255 1419 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 CST9YLR394W 1449 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YCG1YDR325W 3108 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 MET10YFR030W 3108 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 JJJ1YNL227C 1773 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 RSN1YMR266W 2862 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 OPI6YDL096C 327 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 IKI1YHR187W 930 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 COX3Q0275 810 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YJL114WYJL114W 681 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SMD2YLR275W 333 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YOL114CYOL114C 609 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 BUD21YOR078W 645 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 RFC5YBR087W 1065 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 KAR4YCL055W 1008 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 KRE2YDR483W 1329 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YMR046CYMR046C 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN9P53437 FUN30YAL019W 3396 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 TDA1YMR291W 1761 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 NGG1YDR176W 2109 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 SRP68YPL243W 1800 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 TPO5YKL174C 1857 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 RPC37YKR025W 849 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YLR230WYLR230W 306 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 HHF2YNL030W 312 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 END3YNL084C 1050 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 YNL276CYNL276C 396 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 INO4YOL108C 456 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 MGE1YOR232W 687 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 LTP1YPR073C 486 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN9P53437 MDM36YPR083W 1740 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN9P53437 SRC1YML034W 2505 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN9P53437 GYL1YMR192W 2163 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN9P53437 MUS81YDR386W 1899 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN9P53437 AEP1YMR064W 1557 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN9P53437 CHO2YGR157W 2610 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN9P53437 QCR10YHR001W-A 234 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN9P53437 YJL032WYJL032W 315 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN9P53437 YKR011CYKR011C 1062 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN9P53437 FAR3YMR052W 615 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN9P53437 TRM82YDR165W 1335 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN9P53437 RIF1YBR275C 5751 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN9P53437 VAC14YLR386W 2643 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN9P53437 SRP1YNL189W 1629 nt2.82□□□□□ -1.96
RRN9P53437 TOM70YNL121C 1854 nt2.82□□□□□ -1.96
RRN9P53437 DIG2YDR480W 972 nt2.82□□□□□ -1.96
RRN9P53437 RTT105YER104W 627 nt2.82□□□□□ -1.96
RRN9P53437 ATG10YLL042C 504 nt2.82□□□□□ -1.96
RRN9P53437 RSM19YNR037C 276 nt2.82□□□□□ -1.96
RRN9P53437 snR35snR35 204 nt2.82□□□□□ -1.96
RRN9P53437 YNL011CYNL011C 1335 nt2.82□□□□□ -1.96
RRN9P53437 YTA7YGR270W 4140 nt2.82□□□□□ -1.96
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