Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCNKBP51801 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms