Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TAF6P49848 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF6P49848 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF6P49848 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TAF6P49848 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF6P49848 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF6P49848 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF6P49848 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF6P49848 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF6P49848 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TAF6P49848 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF6P49848 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TAF6P49848 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms