Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSC2P49815 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC2P49815 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC2P49815 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC2P49815 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC2P49815 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC2P49815 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC2P49815 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC2P49815 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms