Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
NESP48681 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NESP48681 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NESP48681 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NESP48681 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NESP48681 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NESP48681 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NESP48681 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NESP48681 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NESP48681 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NESP48681 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NESP48681 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NESP48681 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NESP48681 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NESP48681 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NESP48681 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NESP48681 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NESP48681 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NESP48681 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NESP48681 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NESP48681 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NESP48681 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
NESP48681 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NESP48681 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NESP48681 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NESP48681 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NESP48681 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NESP48681 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NESP48681 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NESP48681 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NESP48681 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NESP48681 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
NESP48681 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NESP48681 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
NESP48681 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms