Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMPOP42166 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMPOP42166 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMPOP42166 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMPOP42166 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMPOP42166 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMPOP42166 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMPOP42166 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMPOP42166 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMPOP42166 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMPOP42166 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMPOP42166 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMPOP42166 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMPOP42166 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMPOP42166 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMPOP42166 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMPOP42166 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMPOP42166 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TMPOP42166 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMPOP42166 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TMPOP42166 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMPOP42166 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMPOP42166 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMPOP42166 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms