Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 YHR097CYHR097C 1101 nt2.85□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 VMA5YKL080W 1179 nt2.85□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 YLL047WYLL047W 384 nt2.85□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 NDL1YLR254C 570 nt2.85□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 FKS3YMR306W 5358 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 SPH1YLR313C 1593 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 RNH202YDR279W 1053 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 YEL075CYEL075C 369 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 YKL162CYKL162C 1209 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 REC102YLR329W 795 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 AAR2YBL074C 1068 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 DUG3YNL191W 1074 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 YPL276WYPL276W 438 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 HBT1YDL223C 3141 nt2.84□□□□□ -1.95
SHQ1P40486 RED1YLR263W 2484 nt2.84□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.84□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 SEC26YDR238C 2922 nt2.84□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 WHI3YNL197C 1986 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 DSE4YNR067C 3354 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 MED1YPR070W 1701 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 JSN1YJR091C 3276 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 RRG1YDR065W 1098 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YDR336WYDR336W 945 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YGL138CYGL138C 1038 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 PEX14YGL153W 1026 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YLR076CYLR076C 423 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YBL028CYBL028C 321 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YNR062CYNR062C 984 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 IZH4YOL101C 939 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YPR203WYPR203W 309 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 SRP68YPL243W 1800 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 RRI1YDL216C 1323 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 KIN82YCR091W 2163 nt2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 GIN4YDR507C 3429 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YIL161WYIL161W 708 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 SAW1YAL027W 786 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 NET1YJL076W 3570 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YCK2YNL154C 1641 nt2.82□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 MPC3YGR243W 441 nt2.81□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 SYS1YJL004C 612 nt2.81□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YJR020WYJR020W 333 nt2.81□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 ARC19YKL013C 516 nt2.81□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 RPL20AYMR242C 519 nt2.81□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YNL171CYNL171C 369 nt2.81□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.81□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 EAP1YKL204W 1899 nt2.81□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 SST2YLR452C 2097 nt2.81□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 PSY2YNL201C 2577 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 ECM11YDR446W 909 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YGR160WYGR160W 612 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YJR071WYJR071W 369 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 MCT1YOR221C 1083 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 SRB8YCR081W 4284 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 MET6YER091C 2304 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 HAA1YPR008W 2085 nt2.8□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 BNI4YNL233W 2679 nt2.79□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YDL050CYDL050C 372 nt2.79□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 PRP18YGR006W 756 nt2.79□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.79□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 CPR7YJR032W 1182 nt2.79□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 MIC27YNL100W 705 nt2.79□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 SSP2YOR242C 1116 nt2.79□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 POL30YBR088C 777 nt2.79□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 PDR3YBL005W 2931 nt2.79□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 PDR1YGL013C 3207 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YLR001CYLR001C 2589 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 PSP1YDR505C 2526 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 ERP3YDL018C 678 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YDR535CYDR535C 501 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YGR073CYGR073C 372 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 RNR2YJL026W 1200 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YLR400WYLR400W 474 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 ATP11YNL315C 957 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 MPD2YOL088C 834 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YKL100CYKL100C 1764 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 YJL132WYJL132W 2253 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 SAP1YER047C 2694 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 RPO41YFL036W 4056 nt2.78□□□□□ -1.96
SHQ1P40486 VPS9YML097C 1356 nt2.77□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 IRC3YDR332W 2070 nt2.77□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 RCE1YMR274C 948 nt2.77□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YNL203CYNL203C 612 nt2.77□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 KEL2YGR238C 2649 nt2.77□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 ADY4YLR227C 1482 nt2.77□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 ESC1YMR219W 4977 nt2.77□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 PRP8YHR165C 7242 nt2.76□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 MPS2YGL075C 1164 nt2.76□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 RGI2YIL057C 495 nt2.76□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YKL066WYKL066W 444 nt2.76□□□□□ -1.97
SHQ1P40486 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.7 ms