Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RCVRNP35243 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms