Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBP1P32455 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBP1P32455 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP1P32455 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP1P32455 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBP1P32455 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP1P32455 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP1P32455 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP1P32455 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP1P32455 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP1P32455 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP1P32455 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBP1P32455 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBP1P32455 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBP1P32455 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBP1P32455 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBP1P32455 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms