Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC8A1P32418 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC8A1P32418 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms