Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC8P31273 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC8P31273 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms