Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNFRSF8P28908 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFRSF8P28908 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms