Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCP2P22307 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCP2P22307 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCP2P22307 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCP2P22307 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCP2P22307 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCP2P22307 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCP2P22307 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCP2P22307 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms