Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NFKB1P19838 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NFKB1P19838 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NFKB1P19838 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NFKB1P19838 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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NFKB1P19838 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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NFKB1P19838 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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NFKB1P19838 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NFKB1P19838 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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