Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL17P18621 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPL17P18621 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL17P18621 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL17P18621 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL17P18621 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL17P18621 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms