Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1P11387 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1P11387 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOP1P11387 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOP1P11387 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOP1P11387 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOP1P11387 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1P11387 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1P11387 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1P11387 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1P11387 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1P11387 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1P11387 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1P11387 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1P11387 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1P11387 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms