Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP3P08254 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP3P08254 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP3P08254 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP3P08254 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP3P08254 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP3P08254 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP3P08254 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP3P08254 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP3P08254 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP3P08254 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP3P08254 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP3P08254 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP3P08254 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP3P08254 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP3P08254 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP3P08254 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms