Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
POP4O95707 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POP4O95707 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POP4O95707 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POP4O95707 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POP4O95707 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POP4O95707 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POP4O95707 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POP4O95707 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms