Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD1O95696 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD1O95696 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD1O95696 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD1O95696 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD1O95696 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD1O95696 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD1O95696 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD1O95696 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD1O95696 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRD1O95696 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD1O95696 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRD1O95696 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRD1O95696 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRD1O95696 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD1O95696 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD1O95696 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms