Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL18O94889 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL18O94889 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL18O94889 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLHL18O94889 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms