Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPFIA4O75335 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms