Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
KIAA0556O60303 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
KIAA0556O60303 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
KIAA0556O60303 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms