Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD6O43541 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD6O43541 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD6O43541 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD6O43541 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD6O43541 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD6O43541 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD6O43541 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD6O43541 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD6O43541 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD6O43541 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD6O43541 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD6O43541 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD6O43541 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD6O43541 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD6O43541 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD6O43541 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD6O43541 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD6O43541 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms