Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HTRA2O43464 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA2O43464 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 361.9 ms