Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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HOXA3O43365 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA3O43365 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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