Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM6AO15550 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM6AO15550 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms