Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
J3QW42 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
J3QW42 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
J3QW42 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
J3QW42 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
J3QW42 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms