Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC169A6NNP5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms